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ChIP-Seq測(cè)序與分析

產(chǎn)品簡(jiǎn)介:ChIP-Seq測(cè)序與分析 是指通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,并對(duì)其進(jìn)行純化和文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息,是目前在全基因組水平研究蛋白結(jié)合靶DNA序列的重要手段,為轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學(xué)的研究提供有效方法。

產(chǎn)品型號(hào):

更新時(shí)間:2024-07-18

廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家

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ChIP-Seq測(cè)序與分析

ChIP-Seq測(cè)序與分析 是指通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 片段,并對(duì)其進(jìn)行純化和文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA 片段進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息,是目前在全基因組水平研究蛋白結(jié)合靶DNA序列的重要手段,為轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學(xué)的研究提供有效方法。其將染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)與高通量測(cè)序(Sequencing)技術(shù)相結(jié)合,是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的經(jīng)典實(shí)驗(yàn)方法。

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實(shí)驗(yàn)流程


ChIP-seq生物信息分析流程.png

分析流程


該技術(shù)的主要優(yōu)勢(shì):

1) 全基因組覆蓋:ChIP-seq相較于傳統(tǒng)的ChIP芯片,能夠?qū)崿F(xiàn)全基因組范圍的、單堿基水平的蛋白結(jié)合位點(diǎn)篩選與鑒定;

2) 高靈敏度:每個(gè)樣本可獲得數(shù)百萬(wàn)條的序列標(biāo)簽,可發(fā)現(xiàn)研究基因組上稀有的蛋白結(jié)合位點(diǎn);

3) 高精確率:可獲得高水平的信噪比數(shù)據(jù),準(zhǔn)確區(qū)分真實(shí)事件與噪音,精確定位蛋白結(jié)合位點(diǎn)。


該技術(shù)在基礎(chǔ)研究中的應(yīng)用:

1) 應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的研究:ChIP-seq技術(shù)廣泛應(yīng)用于與轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的生物學(xué)作用與相關(guān)機(jī)制的研究。分析轉(zhuǎn)錄因子在不同細(xì)胞、不同狀態(tài)下所發(fā)揮的作用;

2) 應(yīng)用于組蛋白修飾的研究:ChIP-seq技術(shù)亦常應(yīng)用于研究組蛋白的修飾分布,通過(guò)觀察組蛋白修飾的分布情況,進(jìn)一步明確組蛋白修飾所發(fā)揮的生物學(xué)作用;

3) 應(yīng)用于核小體定位研究:運(yùn)用ChIP-seq技術(shù)研究核小體的分布規(guī)律,進(jìn)而分析得知核小體對(duì)基因表達(dá)所產(chǎn)生的影響。


公司簡(jiǎn)介

上海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co.,LTD) 是一家專注于生命科學(xué)領(lǐng)域提供相關(guān)試劑產(chǎn)品和服務(wù)的生物高科技企業(yè),坐落于上海聚科生物產(chǎn)業(yè)園。公司提供種類齊全的細(xì)胞系和多種原代細(xì)胞、質(zhì)量穩(wěn)定的細(xì)胞培養(yǎng)試劑產(chǎn)品、成熟高效的技術(shù)服務(wù)。本著“守正創(chuàng)新,科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)"的理念,我們以高標(biāo)準(zhǔn)塑造行業(yè)品牌,以全新視野構(gòu)建現(xiàn)代企業(yè),勇于探索和創(chuàng)新。公司業(yè)務(wù)范圍涉及全國(guó)各省市自治區(qū),與國(guó)內(nèi)多家醫(yī)院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作關(guān)系,贏得了良好的市場(chǎng)聲譽(yù)和廣泛的認(rèn)可,我們保證將繼續(xù)為廣大科研用戶提供專業(yè)、高效、優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品及服務(wù)!

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